ՀԱՅԱՍՏԱՆԻ ԿԵՆՍԱԲԱՆԱԿԱՆ ՀԱՆԴԵՍ =Biological Journal of Armenia

Study of Molecular Dynamics of Lamellar Phase of Amphiphile/Water Systems

Poghosyan, A. H. (2014) Study of Molecular Dynamics of Lamellar Phase of Amphiphile/Water Systems. Հայաստանի կենսաբանական հանդես Biological Journal of Armenia Биологический журнал Армении, 66 (3). pp. 78-80. ISSN 0366-5119

[img]
Preview
PDF - Requires a PDF viewer such as GSview, Xpdf or Adobe Acrobat Reader
656Kb

Abstract

The lamellar phase of amphiphile/water system was investigated by using atomic scale simulation. A 300 ns parallel molecular dynamics (MD) simulation was carried out for amphi-phile/water system consisting of 128 sodium pentadecyl sulfonate (SPDS) and 2251 water molecules using GROMACS software package. At T=323K temperature we got both tilted fully interdigitated and liquid crystalline like disordered hydrocarbon chains, i.e. we observe a gel phase that coexists with a lamellar Lα phase. Ուսումնասիրվել է երկսեր նյութ/ջուր լամելային փուլը օգտագործելով ատոմական մակարդակի համակարգչային մոդելավորում: Իրականացվել է 300 նվ զուգահեռ մոլեկուլային դինամիկ ուսումնասիրություն որպես համակարգ վերցնելով` երկսեր նյութ/ջուր համակարգը, բաղկացած 128 նատրիումի պենտադեցիլ սուլֆոնատի և 2251 ջրի մոլեկուլներից օգտագործելով GROMACS ծրագրային փաթեթը: T=323K ջերմաստիճանի դեպքում, ստացվել են պոչերի իրար մեջ լրիվ ներթափանցում, ինչպես նաև հեղուկ բյուրեղական չկարգավորված պոչեր, այսինքն դիտվել է «գել» փուլ, որը համագոյակցում է լամելային Lα փուլի հետ: При помощи компьютерного моделирования на атомарном уровне была исследована ламелярная фаза системы амфифильное вещество/вода. Была проведена параллельная молекулярно-динамическая (МД) симуляция длительностью 300 нс для системы, состоящей из 128 молекул пентадецил сульфоната натрия (ПДСН) и 2251 молекулы воды, с использованием программного пакета GROMACS. При температуре T=323K мы получили как наклоненные полностью взаимопроникающие, так и жидко-кристаллические неупорядоченные углеводородные цепи, то есть наблюдалось сосуществование гель и ламелярной Lα фаз.

Item Type:Article
Additional Information:Молекулярно-динамическое исследование ламеллярной фазы систем амфифильное вещество /вода / А. Г. Погосян. Երկսեր նյութ/ջուր համակարգի լամելային փուլի ուսումնասիրությունը մոլեկուլային դինամիկայի մեթոդով / Ա. Հ. Պողոսյան։
Uncontrolled Keywords:Molecular dynamics (MD) simulations – alkyl sulfonates
Subjects:Biology > Hydrobiology
ID Code:11145
Deposited By:Ruzan Tumanyan
Deposited On:11 Nov 2014 13:55
Last Modified:11 Nov 2014 13:55

Repository Staff Only: item control page