ՀԱՅԱՍՏԱՆԻ ԿԵՆՍԱԲԱՆԱԿԱՆ ՀԱՆԴԵՍ =Biological Journal of Armenia

Study of poly(dA) structure in the acidic media

Antonyan, A. P. and Minasyants, M. V. and Vardevanyan, P. O. (2015) Study of poly(dA) structure in the acidic media. Հայաստանի կենսաբանական հանդես Biological Journal of Armenia Биологический журнал Армении, 2015 (67). pp. 29-35. ISSN 0366-5119

[img]
Preview
PDF - Requires a PDF viewer such as GSview, Xpdf or Adobe Acrobat Reader
520Kb

Abstract

The study of EtBr (ethidium bromide) interaction with poly(dA) at different pH of solution has been carried out. The obtained data revealed that poly(dA) depending on pH may be in different structural states – double-stranded at 4.0 > pH > 3.0 and singlestranded in neutral (pH≈7.0), weak acidic (6.0 > pH ≥ 5.5) and strong acidic (pH < 3.0) conditions. It was shown that EtBr binds to poly(dA) by intercalation at pH≈3.5 as well as semi-intercalation at pH≈7.0 and pH≈5.5 modes. From the obtained data it was also revealed that EtBr binding mechanisms are universal and practically do not depend on medium conditions.Իրականացվել է poly(dA)-ի հետ ԷԲ-ի (էթիդիում իբրոմիդ) փոխազդեցության ուսումնասիրություն լուծույթի տարբեր pH-ների դեպքում: Ստացված տվյալները ցույց են տվել, որ poly(dA)-ն, կախված pH-ից, կարող է գտնվել տարբեր կառուցվածքային վիճակներում՝ երկշղթա 4.0 > pH > 3.0 և միաշղթա չեզոք (pH≈7.0), թույլ թթվային (6.0 > pH ≥ 5.5) և ուժեղ թթվային (pH < 3.0) պայմաններում: Հայտնաբերվել է, որ ԷԲ-ն poly(dA)-ի հետ կապվում է ինտերկալյացիոն), ինչպես նաև կիսաինտերկալյացիոն (pH≈7.0) և (pH≈5.5) եղանակներով: Ստացված տվյալները նաև ցույց են տալիս, որ ԷԲ-ի կապման մեխանիզմները ունիվերսալ են և գործնականում կախված չեն միջավայրի պայմաններից:Исследовалось взаимодействие БЭ (бромистый этидий) с poly(dA) при различных pH раствора. Полученные данные выявили, что poly(dA), в зависимости от pH раствора может находится в различных структурных состояниях– двухцепочечном при 4.0 > pH > 3.0 и одноцепочечном при нейтральном (pH≈7.0), слабокислом (6.0 > pH ≥ 5.5) и сильнокислом (pH < 3.0) условиях. Обнаружено, что БЭ с poly(dA) связывается интеркаляционным при pH≈3.5 и полуинтеркаляционным при pH≈7.0 и pH≈5.5 способами. Полученные данные свидетельству-ют о том, что механизмы связывания БЭ являются универсальными и практически не зависят от условий среды.

Item Type:Article
Additional Information:Poly(dA)-ի կառուցվածքի ուսումնասիրությունը թթվային միջավայրերում / Ա. Պ. Անտոնյան, Մ. Վ. Մինասյանց, Պ. Հ. Վարդևանյան։ Изучение структуры poly(dA) в кислых средах / А. П. Антонян, М. В.Минасянц, П. О. Вардеванян.
Uncontrolled Keywords:Poly(dA) – ethidium bromide –absorption spectrum –intercalation –semi-intercalation – electrostatic binding
Subjects:Biology > Biochemistry
ID Code:11195
Deposited By:Ruzan Tumanyan
Deposited On:29 Jun 2015 11:35
Last Modified:29 Jul 2015 08:03

Repository Staff Only: item control page