ՀԱՅԱՍՏԱՆԻ ԿԵՆՍԱԲԱՆԱԿԱՆ ՀԱՆԴԵՍ =Biological Journal of Armenia

The utility of sufficiently informative protein multiple sequence alignment for cancer risk assessment OF BRCA2 missense substitutions

Babikyan, D. T. (2016) The utility of sufficiently informative protein multiple sequence alignment for cancer risk assessment OF BRCA2 missense substitutions. Հայաստանի կենսաբանական հանդես Biological Journal of Armenia Биологический журнал Армении, 68 (4). pp. 76-80. ISSN 0366-5119

[img]
Preview
PDF - Requires a PDF viewer such as GSview, Xpdf or Adobe Acrobat Reader
650Kb

Abstract

Although the breast cancer risk, that is specific to BRCA1 and BRCA2 genes, is similar one to another, the analysis of missense substitutions has focused mainly on BRCA1. However, more than 40% of BRCA2 full-sequence tests in which a reportable DNA sequence variant is found present unclassified missense variants. The results of this study present amino acid sequence conservation across BRCA2 protein using protein multiple sequence alignment of 12 BRCA2 orthologs capturing enough evolutionary time to predict the role of unclassified missense variants of BRCA2 gene on BRCA2 protein function by means of bioinformatics analysis.Չնայած BRCA1 և BRCA2 գեներին բնորոշ է կրծքագեղձի քաղցկեղի զարգացման նույնանման գենետիկական ռիսկ, հիմնականում ուսումնասիրվել են BRCA1 գենի միսսենս տեղակալումները: Այնուամենայնիվ, գենետիկական թեստերի միջոցով հայտնաբերված BRCA2 գենի ամբողջ հաջորդականության փոփոխությունների 40% իրենցից ներկայացնում են չդասակարգված միսսենս տարբերակներ: Այս հետազոտության արդյունքները ցույց են տալիս BRCA2 սպիտակուցի ամինաթթվային հաջորդականության կոնսերվացիան՝ 12 BRCA2 օրթոլոգ սպիտակուցների բազմակի հաջորդականությունների համադրման կիրառմամբ: Վերջինը ընդգրկում է բավարար էվոլյուցիոն ժամանակահատված՝ BRCA2 սպիտակուցի ֆունկցիայի վրա BRCA2 գենում չդասակարգված միսսենս տարբերակների դերի կանխորոշման համար՝ կենսաինֆորմատիկ վերլուծության միջոցով:Мутации генов BRCA1 и BRCA2 способствуют повышенному риску развития рака молочной железы. Поиск миссенс-мутаций был сосредоточен главным образом на гене BRCA1. Тем не менее, при секвенировании последовательностей гена BRCA2 выявлено более 40% неклассифицированных миссенс-вариантов. В данном исследовании использованы методы выравнивания последовательностей 12 ортологов белка BRCA2 с использованием биоинформатического метода. Полученные результаты свидетельствуют о стабильности аминокислотной последовательности белка BRCA2 на протяжении длительного эволюционного периода, достаточного для прогнозирования влияния неклассифицированных миссенс-вариантов гена BRCA2 на функции белка BRCA2.

Item Type:Article
Additional Information:Բավականաչափ ինֆորմատիվ սպիտակուցների բազմակի հաջորդականությունների համադրության կիրառումը BRCA2 միսսենս տեղակալումների քաղցկեղի ռիսկի գնահատման համար / Դ. Թ. Բաբիկյան։ Информативность метода множественного выравнивания белковых последовательностей для определения миссенс-вариантов гена BRCA2 и риска развития рака / Д.T. Бабикян.
Uncontrolled Keywords:Missense substitutions – BRCA2 gene – protein multiple sequence alignment
Subjects:Biology > Biology General
Medicine > Medicine (General)
ID Code:11346
Deposited By:Ruzan Tumanyan
Deposited On:24 Jan 2017 13:42
Last Modified:24 Jan 2017 13:42

Repository Staff Only: item control page