ՀԱՅԱՍՏԱՆԻ ԿԵՆՍԱԲԱՆԱԿԱՆ ՀԱՆԴԵՍ =Biological Journal of Armenia

Insights on glucocorticoid receptor modulation through binding of artemisinin

Ginosyan, S. V. and Grabski, H. V. and Tiratsuyan, S. G. (2017) Insights on glucocorticoid receptor modulation through binding of artemisinin. Հայաստանի կենսաբանական հանդես Biological Journal of Armenia Биологический журнал Армении, 69 (1). pp. 104-109. ISSN 0366-5119

[img]
Preview
PDF - Requires a PDF viewer such as GSview, Xpdf or Adobe Acrobat Reader
880Kb

Abstract

In this work in silico study of the interaction of artemisinin with ligand bind domain of glucocorticoid receptor by molecular modeling methods. Artemisinins belong to the family of sesquiterpene lactones, secondary metabolites of medicinal plant Artemisia annua, which has been traditionally used in Chinese medicine. Artemisinins exhibit antioxidant, anti-inflammatory, anticarcinogenic and other activities. Molecular docking, principal component analysis, cluster analysis have revealed three binding sites of artemisinin with ligand bind domain of glucocorticoid receptor which are very important regions. Comparative analysis was performed with dexamethasone, which is a corticosteroid medication. Thus, we have shown for the first time that artemisinin affects extremely important sites of ligand bind domain of glucocorticoid receptor, it should be noted that the first binding site of artemisinin corresponds to the interaction site of dexamethasone. This may represent a molecular basis for ligand-dependent receptor activation and the possibility of using artemisinin as a new ligand for glucocorticoid receptor. В данной работе изучено insilico взаимодействие артемизинина с лиганд связывающим доменом глюкокортикоидного рецептора методами молекулярного моделирования. Артемизинины относятся к семейству сесквитерпеновых лактонов, вторичных метаболитов лекарственного растения Artemisiaannua, которое традиционно используется в китайской медицине. Артемизинины проявляют антиоксидантную, противовоспалительную, антиканцерогенную и др. активности. Методами молекулярного докинга, анализа по главным компонентам и кластерного анализа выявлено три сайта связывания артемизинина с лиганд связывающим доменом глюкокортикоидного рецептора, которые являются чрезвычайно важными участками. Проведен сравнительный анализ с кортикостероидным препаратом дексаметазоном. Нами впервые показано, что артемизинин влияет на чрезвычайно важные участки лиганд связывающим доменом глюкокортикоидного рецептора, при этом первый сайт связывания артемизинина соответствует сайту взаимодействия дексаметазона. Это может представлять молекуляр105 ную основу для лиганд-зависимой активации рецептора и рассмотрения возможности использования артемизинина в качестве нового лиганда для этого рецептора. Այս աշխատանքում իրականացված է արտեմիզինինի և գլյուկոկորտիկոիդային ընկալիչի լիգանդ կապող դոմենի փոխազդեցության ուսումնասիրություն insilico մոլեկուլային մոդելավորման մեթոդների միջոցով: Արտեմիզինինները պատկանում են սեսքվիթերպենային լակտոնների ընտանիքին, հանդիսանալով Artemisiaannua դեղաբույսերի երկրորդային մետաբոլիտ, որն ավանդաբար օգտագործվում է չինական բժշկության մեջ: Արտեմիզինինները ցուցաբերում են հակաօքսիդանտային, հակաբորբոքոային, հակաքաղցկեղածին և այլ ակտիվություններ: Մոլեկուլային դոքինգի, հիմնական բաղադրիչերի վերլուծության, կլաստերային վերլուծության միջոցով հայտնաբերվել է արտեմիզինինի և գլյուկոկորտիկոիդային ընկալիչի լիգանդկապող դոմենի միջ և կապման երեք կայք, որոնց չափազանց կարևւոր են: Կատարվել է համեմատական վերլուծություն դեքսամետազոնի որպես կորտիկոսթերոիդային դեղանյութի հետ: Այսպիսով, առաջին անգամ ցույց է տրվել, որ արտեմիզինը փոխազդում է գլյուկոկորտիկոիդային ընկալիչիլի լիգանդկապող դոմենի հետ չափազանց կարևոր կայքերի հետ, ընդորում նրա առաջին կայքը համապատասխանում է դեքսամետազոնի փոհազդեցության կայքի հետ: Սա կարող է մոլեկուլային հիմք հանդիսանալ լիգանդից կախված ընկալիչի ակտիվացման և արտեմիզինի դիտարկման հնարավորությանը որպես նոր լիգանդ:

Item Type:Article
Uncontrolled Keywords:Глюкокортикоидный рецептор – артемизинин – дексаметазон – молекулярный докинг – кластерный анализ, Glucorticoid receptor – artemisinin – dexamethasone - molecular docking – cluster analysis, Գլյուկոկորտիկոիդային ընկալիչ – արտեմիզինին – դեքսամետազոն – մոլեկուլային դոքինգ–կլաստերային վերլուծություն
Subjects:Biology > Biology General
ID Code:11453
Deposited By:Ruzan Tumanyan
Deposited On:18 Dec 2017 09:55
Last Modified:18 Dec 2017 09:55

Repository Staff Only: item control page