ՀԱՅԱՍՏԱՆԻ ԿԵՆՍԱԲԱՆԱԿԱՆ ՀԱՆԴԵՍ =Biological Journal of Armenia

Interaction of Meso-tetra-(4N-allylpyridyl) porphyrin and its Cu-, Co- and Zn- containing derivatives with DNA

Barkhudaryan, V. G. and Ananyan, G. V. (2017) Interaction of Meso-tetra-(4N-allylpyridyl) porphyrin and its Cu-, Co- and Zn- containing derivatives with DNA. Հայաստանի կենսաբանական հանդես Biological Journal of Armenia Биологический журнал Армении, 4 (69). pp. 84-93. ISSN 0366-5119

[img]
Preview
PDF - Requires a PDF viewer such as GSview, Xpdf or Adobe Acrobat Reader
623Kb

Abstract

The influence of water soluble cationic meso-tetra-(4N-allylpyridyl) porphyrin (H2TAlPyP4) and its metal complexes with Cu-, Co- and Zn- on hydrodynamic and spectral behaviour of ct-DNA solutions has been studied by viscometry and UV-VIS spectrophotometry methods. The results obtained were compared with the results of previously conducted similar studies on meso-tetra-(3N-allylpyridyl) porphyrin (H2TAlPyP3). It has been shown that the change in position of peripheral radicals on pyridylic ring has absolutely no effect on rules of interaction of investigated porphyrins with DNA in case of outside binders CoTAlPyP4 and ZnTAlPyP4. Planar porphyrin H2TAlPyP4 interacts with DNA predominantly by intercalation mode at low relative concentrations of r (r = [Porphyrin] / [DNA]) and by external binding mode at high values of r. Unusual behaviour shows CuTAlPyP4, which interacts with DNA via non-classical (partial) binding mode. It was shown that H2TAlPyP3 and its metal complexes bind to DNA much more intensely than H2TAlPyP4 and its metal complexes. Մածուցիկաչափության և սպեկտրոֆոտոմետրիայի մեթոդներով հետազոտվել է ջրալուծ կատիոնային մեզո-տետրա-(4N-ալլիլպիրիդիլ) պորֆիրինի (H2TAlPyP4) և Cu-ի, Co-ի և Zn-ի հետ նրա համալիրների ազդեցությունը ԴՆԹ-ի լուծույթների հիդրոդինամիկական և սպեկտրալ հատկությունների վրա: Ստացված արդյունքները համեմատվել են մեզո-տետրա-(3N-ալլիլպիրիդիլ) պորֆիրինի (H2TAlPyP4) հետ նախկինում իրականացված նմանատիպ հետազոտությունների արդյունքների հետ: Ցույց է տրվել, որ պիրիդիլային օղակում կողմնային ռադիկալների դիրքի փոփոխությունը բացարձակապես չի ազդում հետազոտվող պորֆիրինների՝ ԴնԹ-ի հետ փոխազդեցության օրինաչափությունների վրա արտաքինից կապվող CoTAlPyP4-ի և ZnTAlPyP4-ի դեպքում: Հարթ կառուցվածքով H2TAlPyP4-պորֆիրինը ԴՆԹ-ի հետ առավելապես փոխազդում է ինտերկալման վարքագծով ցածր r (r = [Porphyrin] / [DNA]) հարաբերական կոնցենտրացիաների և արտաքին կապումով՝ մեծ կոնցենտրացիաների դեպքում: Անսովոր վարքագիծ է դրսևորում CuTAlPyP4-ը, որը ԴՆԹ-ի հետ փոխազդում է ոչ դասական (մասնակի) կապման ռեժիմով: Ցույց է տրվել, որ H2TAlPyP3-ը և նրա մետաղակոմպլեքսները ԴՆԹ-ի հետ ավելի ինտենսիվ են փոխազդում, քան H2TAlPyP4-ը և նրա մետաղակոմպլեքսները:Методами вискозиметрии и спектрофотометрии изучено влияние водорастворимого катионного мезо-тетра-(4N-аллилпиридил) порфирина (H2TAlPyP4) и его комплексов с Cu-, Co- и Zn- на гидродинамическое и спектральное поведение растворов ДНК. Полученные ре-зультаты сравнивались с результатами ранее проведенных аналогичных исследований мезо- тетра-(3N-аллилпиридил) порфирина (H2TAlPyP3).Показано, что изменение положения периферических радикалов на пиридиловом кольце абсолютно не влияет на закономерности взаимодействия исследованных порфиринов с ДНК в случае внешних связующих CoTAlPyP4 и ZnTAlPyP4. Планарный порфирин H2TAlPyP4 взаимодействует с ДНК преимущественно интеркаляционным режимом при низких относительных концентрациях r (r = [Porphyrin] / [DNA]) и внешним режимом связывания при высоких значениях r. Необычное поведение проявляет CuTAlPyP4, который взаимодействует с ДНК по неклассическому (частичному) режиму связывания. Было показано, что H2TAlPyP3 и его металлокомплексы связываются с ДНК намного интенсивнее, чем H2TAlPyP4 и его металлокомплексы.

Item Type:Article
Additional Information:Մեզո-տետրա-(4N-ալլիլպիրիդիլ) պորֆիրինի և նրա Cu, Co և Zn պարունակող ածանցյալների փոխազդեցությունը ԴՆԹ-ի հետ / Վ. Գ. Բարխուդարյան, Գ. Վ. Անանյան: Взаимодействие мезо-тетра- (4N-аллилпиридил)порфирина и его Cu-, Co- и Zn-содержащих производных с ДНК / В. Г. Бархударян, Г. В. Ананян.
Uncontrolled Keywords:Porphyrin – ct-DNA – Viscometry – intercalation – outside binding – partial intercalation
Subjects:Biology > Molecular Biology
Biology > Biophysics
ID Code:11468
Deposited By:Ruzan Tumanyan
Deposited On:18 Dec 2017 10:49
Last Modified:18 Dec 2017 10:49

Repository Staff Only: item control page