ՀԱՅԱՍՏԱՆԻ ԿԵՆՍԱԲԱՆԱԿԱՆ ՀԱՆԴԵՍ =Biological Journal of Armenia

Heterocyclic substituted non-protein amino acids as inhibitors of Clostridium histolyticum collagenase

Sargsyan, A.S. and Babayan, B.G. and Avetisyan, N. S. and Mkrtchyan, A. G. and Hovhannisyan, A. M. and Hovhannisyan, N. A. (2018) Heterocyclic substituted non-protein amino acids as inhibitors of Clostridium histolyticum collagenase. Հայաստանի կենսաբանական հանդես Biological Journal of Armenia Биологический журнал Армении, 70 (1). pp. 12-15. ISSN 0366-5119

[img]
Preview
PDF - Requires a PDF viewer such as GSview, Xpdf or Adobe Acrobat Reader
460Kb

Abstract

Optically active non-protein α-amino acids have been screened for their ability to interact with collagenase of Clostridium histolyticum. Both structure-based drug design approach (modeling) and that of determining enzyme activity in the presence of amino acids have been used to identify low molecular weight inhibitors of collagenase. According to the docking analysis, a number of non-protein amino acids have demonstrated ability to form bounds with collagenase. Following the docking analysis, enzyme activity has been determined in the presence of investigated amino acids. The results have indicated that (S)-β-[4-allyl-3-butyl-5-thioxo-1,2,4-triazol-1-yl]-α-alanine, (S)-β-[4-allyl-3-(pyridin-4’-yl)-5-thioxo-1,2,4-triazol-1-yl]-α-alanine and (S)-β-[4-allyl-3-(pyridin-3’-yl)-5-thioxo-1,2,4-triazol-1-yl]-α-alanine inhibit collagenase activity. Իրականացվել է Clostridium histolyticum-ից անջատված կոլագենազի հետ սինթետիկ ամի-նաթթուների փոխազդեցության հատկությունների սքրինինգ: Կոլագենազի ցածրամոլեկուլային արգելակիչների հայտնաբերման նպատակով կիրառվել է երկու մոտեցում՝ մոդելավորման եղանակով դեղերի կառուցում և ամինաթթուների առկայությամբ ֆերմենտային ակտիվության որոշում: Դոքինգ հետազոտության արդյունքների համաձայն մի շարք ամինաթթուներ կոլագենազի հետ կապվելու հատկություն են ցուցաբերել: Այնուհետև չափվել է ֆերմենտի ակտիվությունը՝ հետազոտվող ամինաթթուների առկայության պայմաններում: Արդյունքները ցույց են տվել, որ (S)-β-[4-ալիլ-3-բութիլ-5-թիօքսո-1,2,4-տրիազոլ-1-իլ]-α-ալանինը, (S)-β-[4-ալիլ-3-(պիրիդին-4’-իլ)-5-թիօքսո-1,2,4-տրիազոլ-1-իլ]-α-ալանինը և (S)-β-[4-ալիլ-3-(պիրիդին-3’-իլ)-5-թիօքսո-1,2,4-տրիազոլ-1-իլ]-α-ալանինը հանդիսանում են կոլագենազի արգելակիչներ:Осуществлен скриннинг синтетических аминокислот на способность взаимодействовать с коллагеназой, выделеннной из Clostridium histolyticum. Для выявления низкомолекуляр-ных ингибиторов коллагеназы были использованы два подхода: конструирование лекарств на основе структуры путем моделирования и определение активности фермента в присутствии аминокислот. Согласно данным докинг анализа ряд небелковых аминокислот проявили способность связываться с коллагеназой. Далее определялась активность фермента в присутствии исследуемых аминокислот. Результаты показали, что (S)-β-[4-аллил-3-бутил-5-тиоксо-1,2,4-триазолl-1-ил]-α-аланин, (S)-β-[4-аллил-3-(пиридин-4’-ил)-5-тиоксо-1,2,4-триазол-1-ил]-α-ала-нин и (S)-β-[4-аллил-3-(пиридин-3’-ил)-5-тиоксо-1,2,4-триазол-1-ил]-α-аланин являются ингибиторами коллагеназы.

Item Type:Article
Additional Information:Հետերոցիկլային տեղակալված ոչ սպիտակուցային ամինաթթուները որպես Clostridium histolyticum-ի կոլագենազի արգելակիչներ /Ա.Ս. Սարգսյան, Բ. Բաբայան, Ն. Ս. Ավետիսյան, Ա. Գ. Մկրտչյան, Ա. Մ. Հովհաննիսյան, Ն. Ա. Հովհաննիսյան: Гетероциклически замещенные небелковые аминокислоты как ингибиторы коллагеназы из Clostridium histolyticum А.С. Саргсян, Б. Г. Бабаян, Н. С. Аветисян, А. Г. Мкртчян, А. М. Оганесян, Н. А.Оганесян
Uncontrolled Keywords:Non-protein amino acid – docking – collagenase – inhibitor
Subjects:Biology > Biotechnology
ID Code:11475
Deposited By:Ruzan Tumanyan
Deposited On:10 May 2018 13:26
Last Modified:10 May 2018 13:26

Repository Staff Only: item control page