ՀԱՅԱՍՏԱՆԻ ԿԵՆՍԱԲԱՆԱԿԱՆ ՀԱՆԴԵՍ =Biological Journal of Armenia

Изучение комплексов ДНК с лигандами различной природы

Вардеванян, П. О. and Антонян, А. П. (2010) Изучение комплексов ДНК с лигандами различной природы. Հայաստանի կենսաբանական հանդես Biological Journal of Armenia Биологический журнал Армении, 62 (3). pp. 50-58. ISSN 0366-5119

[img]
Preview
PDF - Requires a PDF viewer such as GSview, Xpdf or Adobe Acrobat Reader
342Kb

Abstract

В работе обобщены данные по исследованию особенностей комплексообразования ДНК с лигандами, которые связываются с ней различными меха-низмами, на примере классического интеркалятора бромистого этидия (БЭ) и неинтеркалятора Hoechst 33258. Показано, что БЭ проявляет мультимодальность, так как может связываться с дц-ДНК тремя – интеркаляционным, полуинтеркаляционным и электростатическим, а с оц-ДНК двумя – полуинтеркаляционным и электростатическим механизмами. Сравнение экспериментально полученных значений параметров взаимодействия с теоретически рассчитанными выявило хорошее соответствие. Показано, что Hoechst 33258 также проявляет мультимодальность при связывании с дц-ДНК, которая зависит от условий внешних факторов, в частности от ионной силы раствора. Աշխատանքում ընդհանրացված են ԴՆԹ-ի հետ տարբեր մեխանիզմներով կապվող լիգանդների կոմպլեքսագոյացման առանձնահատկությունների ուսումնասիրությունները՝ դասական ինտերկալյատոր էթիդիում բրոմիդի (ԷԲ) և ոչ ինտերկալյատոր Hoechst 33258-ի օրինակներով: Ցույց է տրվել, որ ԷԲ-ն դրսևորում է բազմաբնույթ փոխազդեցություն, քանի որ եշ-ԴՆԹ-ի հետ կարող է կապվել երեք՝ ինտերկալյացիոն, կիսաինտերկալյացիոն և էլեկտրաստատիկ, իսկ մշ-ԴՆԹ-ի հետ՝ երկու՝ կիսաինտերկալյացիոն և էլեկտրաստատիկ մեխանիզմներով: Փոխազդեցության պարամետրերի փորձարարականորեն ստացված արժեքները տեսականորեն հաշվարկվածների հետ լավ համապատասխանության մեջ են: Ցույց է տրվել, որ Hoechst 33258-ը նույնպես դրսևորում է բազմաբնույթ փոխազդեցություն եշ-ԴՆԹ-ի հետ կապվելիս, ինչը կախված է արտաքին գործոնների պայմաններից, մասնավորապես լուծույթի իոնական ուժից: Investigations related to the peculiarities of DNA complexformation with ligands binding by different mechanisms, on examples of classic intercalator ehidium bromide (EtBr), and non-intercalator Hoechst 33258 are generalized in this work. It has been shown that EtBr exhibits multimodality, because it may bind with ds-DNA by three – intercalation, semiintercalation and elecrtostatical, and with ss-DNA by two – semiintercalation and electrostaical mechanisms. The comparison of experimental values of interaction parameters to theoretically calculated ones reveals a good correlation. It has been shown that Hoechst 33258 also exhibits multimodality at the binding with ds-DNA, which depends on conditions of external factors, particularly, on ionic strength of solution.

Item Type:Article
Additional Information:Տարբեր բնույթի լիգանդների հետ ԴՆԹ-ի համալիրների ուսումնասիրումը / Պ. Հ. Վարդևանյան, Ա. Պ. Անտոնյան։ Study of DNA complexes with ligands of different nature / P. O. Vardevanyan, A. P. Antonyan.
Uncontrolled Keywords:ДНК – БЭ - Hoechst 33258 – интеркаляция – полуинтеркаляция – мультимодальность. ԴՆԹ - ԷԲ - Hoechst 33258 - ինտերկալյացիա - կիսաինտերկալյացիա - բազմաբնույթ լիգանդ։ DNA – EB - Hoechst 33258 – intercalation – semiintercalation – ultimodality.
Subjects:Biology > Biophysics
ID Code:4790
Deposited By:Ruzan Tumanyan
Deposited On:08 Aug 2011 10:09
Last Modified:16 Feb 2014 15:38

Repository Staff Only: item control page