ՀԱՅԱՍՏԱՆԻ ԿԵՆՍԱԲԱՆԱԿԱՆ ՀԱՆԴԵՍ =Biological Journal of Armenia

Pequliarities of interaction of ethidium bromide with different GC-content DNAs

Vardevanyan, P. O. and Karapetyan, R. A. and Parsadanyan, M. A. (2010) Pequliarities of interaction of ethidium bromide with different GC-content DNAs. Հայաստանի կենսաբանական հանդես Biological Journal of Armenia Биологический журнал Армении, 62 (4). pp. 6-11. ISSN 0366-5119

[img]
Preview
PDF - Requires a PDF viewer such as GSview, Xpdf or Adobe Acrobat Reader
211Kb

Abstract

In this work the formation of the ligand-DNA complexes by different modes using absorption and fluorescence spectroscopy methods has been investtigated. Comparison of the obtained results has revealed the existence of two “strong” types of binding modes one of which shows fluorescent signal and therefore represents fully intercalated geometry. Second type of “strong” interaction has no fluorescent signal. The nonfluorescent binding corresponds to the ligand hemi intercalative strong binding sites on DNA, where fluorescence of EtBr is quenched. Nonfluorescent complexes are formed in the minor groove of DNA with a significant affinity to GC-pairs. Աշխատանքում կլանման և ֆլուորեսցենտային սպեկտրոսկոպիայի մեթոդ-ներով հետազոտվել է ԴՆԹ-լիգանդ կոմպլեքսների տարբեր եղանակներով առաջացումը: Ստացված արդյունքների համեմատությունից բացահայտվել է, որ գոյություն ունի ,ուժեղե կապման եղանակի երկու տիպ, որոնցից մեկն ունի ֆլուորեսցենտային ազդակ և ինտերկալյացիոն երկրաչափություն: «Ուժեղ» փոխազդեցության երկրորդ տիպը չունի ֆլուորեսցենտային ազդակ: Չֆլուորեսցենցող կապումը համապատասխանում է ԴՆԹ-ի վրա լիգանդների կիսաինտերկալյացիոն եղանակով կապման տեղերին, որտեղ ԷԲ-ի ֆլուրեսցենցիան մարում է: Չֆլուորեսցենցող կոմպլեքսները առաջանում են ԴՆԹ-ի փոքր ակոսում և նշանակալից խնամակցություն ունեն GC -զույգերի նկատմամբ: В данной работе исследовано образование ДНК-лиганд комплексов разными способами с помощью методов абсорбционной и флуоресцентной спектроскопии. Сопоставление полученных результатов выявило существование двух типов «сильного» способа связывания, один из которых имеет флуоресцентный сигнал и представляет собой интеркаляционную геометрию. Второй тип «сильного» взаимодействия не имеет флуоресцентного сигнала. Нефлуоресцирющее связывание соответствует местам связывания лиганда на ДНК полуинтеркаляционным способом, где флуоресценция БЭ тушится. Нефлуоресцирующие комплексы образуются в малом желобке ДНК и обладают значительным сродством к GC-парам.

Item Type:Article
Additional Information:Տարբեր ԳՑ-պարունակությամբ ԴՆԹ-ների հետ էթիդիումի բրոմիդի փոխազդեցության առանձնահատկությունները / Պ. Հ. Վարդևանյան, Ռ. Ա. Կարապետյան, Մ. Ա. Փարսադանյան։ Особенности взаимодействия бромистого этидия с ДНК с различным GC-содержанием / П. О. Вардеванян, Р. А. Карапетян, М. А. Парсаданян.
Uncontrolled Keywords:DNA – ethidium bromide (EtBr) - intercalation – hemi intercalation – fluorescent complex – nonfluorescent complex. ԴՆԹ — էթիդիումի բրոմիդ (ԷԲ) — ինտերկալյացիա — կիսաինտերկալյացիա — ֆլուրեսցենցող կոմպլեքս — չֆլուորեսցենցող կոմպլեքս։ ДНК – бромистый этидий (БЭ) – интеркаляция – полуинтеркаляция – флуоресцирующий комплекс – нефлуоресцирующий комплекс.
Subjects:Biology > Molecular Biology
ID Code:4806
Deposited By:Ruzan Tumanyan
Deposited On:08 Aug 2011 14:07
Last Modified:16 Feb 2014 15:38

Repository Staff Only: item control page